MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017411	AT	3	6	29	34	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017411	ATT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017411	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017411	AT	3	6	126	131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017411	CAA	2	6	132	137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017411	A	6	6	140	145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017411	A	6	6	161	166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017411	ATA	2	6	179	184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017411	TAT	2	6	218	223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017411	AGTT	2	8	247	254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017411	ATT	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017411	TAC	3	9	316	324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017411	AT	3	6	371	376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017411	A	7	7	388	394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017411	A	7	7	398	404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017411	TATAA	2	10	419	428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017411	TAATA	2	10	432	441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017411	ATGG	2	8	457	464	25 %	25 %	50 %	0 %	387826841
19	NC_017411	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	387826841
20	NC_017411	AAATT	2	10	503	512	60 %	40 %	0 %	0 %	387826841
21	NC_017411	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826841
22	NC_017411	TAA	2	6	605	610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826841
23	NC_017411	A	7	7	695	701	100 %	0 %	0 %	0 %	387826841
24	NC_017411	TGT	2	6	721	726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826841
25	NC_017411	AGA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826841
26	NC_017411	TTG	2	6	789	794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826841
27	NC_017411	TA	3	6	864	869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017411	TAT	2	6	897	902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017411	AAT	2	6	1013	1018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017411	AAAT	2	8	1049	1056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017411	AT	3	6	1061	1066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017411	TAA	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017411	ATT	3	9	1101	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017411	CAAA	2	8	1119	1126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017411	AGA	2	6	1175	1180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017411	T	7	7	1181	1187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017411	TAA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017411	TCT	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017411	AGA	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017411	A	6	6	1264	1269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017411	TA	3	6	1276	1281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017411	ATTGA	2	10	1322	1331	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017411	TAAAC	2	10	1334	1343	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017411	TAA	3	9	1372	1380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017411	TATT	2	8	1396	1403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017411	A	6	6	1414	1419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017411	A	8	8	1433	1440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017411	T	6	6	1481	1486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017411	AAT	2	6	1498	1503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017411	AAT	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017411	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017411	GATT	2	8	1717	1724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017411	T	7	7	1723	1729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017411	A	7	7	1804	1810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017411	TAA	2	6	1835	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017411	ATA	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017411	TAA	2	6	1941	1946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017411	ATTC	2	8	1967	1974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017411	T	6	6	1975	1980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017411	TATT	2	8	2009	2016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017411	ATTTTG	2	12	2055	2066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017411	AT	3	6	2099	2104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017411	A	11	11	2151	2161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017411	CAAA	2	8	2179	2186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017411	AGG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017411	ATT	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017411	AAT	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017411	A	7	7	2320	2326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017411	T	8	8	2347	2354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017411	TTA	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017411	ATT	2	6	2440	2445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826842
72	NC_017411	TGC	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826842
73	NC_017411	CTCA	2	8	2494	2501	25 %	25 %	0 %	50 %	387826842
74	NC_017411	GTC	2	6	2527	2532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826842
75	NC_017411	T	6	6	2533	2538	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
76	NC_017411	TAC	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
77	NC_017411	TTC	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826842
78	NC_017411	ATTA	2	8	2824	2831	50 %	50 %	0 %	0 %	387826842
79	NC_017411	T	6	6	2853	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
80	NC_017411	TGA	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826842
81	NC_017411	GAG	2	6	2889	2894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826842
82	NC_017411	T	7	7	2930	2936	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
83	NC_017411	T	6	6	2950	2955	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
84	NC_017411	ATC	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
85	NC_017411	T	6	6	3024	3029	0 %	100 %	0 %	0 %	387826842
86	NC_017411	TCA	2	6	3113	3118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826842
87	NC_017411	ATT	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826842
88	NC_017411	CCT	2	6	3199	3204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017411	AT	3	6	3221	3226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017411	T	7	7	3300	3306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017411	T	6	6	3330	3335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017411	CTT	2	6	3352	3357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017411	T	7	7	3361	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017411	T	6	6	3372	3377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017411	T	6	6	3392	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017411	T	7	7	3413	3419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017411	T	7	7	3421	3427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017411	AAT	2	6	3604	3609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826843
99	NC_017411	AT	3	6	3637	3642	50 %	50 %	0 %	0 %	387826843
100	NC_017411	A	6	6	3661	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	387826843
101	NC_017411	T	8	8	3669	3676	0 %	100 %	0 %	0 %	387826843
102	NC_017411	T	6	6	3778	3783	0 %	100 %	0 %	0 %	387826843
103	NC_017411	TAAT	2	8	3793	3800	50 %	50 %	0 %	0 %	387826843
104	NC_017411	T	7	7	3815	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017411	TTA	2	6	3845	3850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017411	T	6	6	3897	3902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017411	T	6	6	3904	3909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017411	TAAG	2	8	3926	3933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017411	A	6	6	3955	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	387826844
110	NC_017411	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826844
111	NC_017411	TTCTTT	2	12	3986	3997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826844
112	NC_017411	TATT	2	8	4033	4040	25 %	75 %	0 %	0 %	387826844
113	NC_017411	TAAA	2	8	4067	4074	75 %	25 %	0 %	0 %	387826844
114	NC_017411	CTG	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017411	TGT	2	6	4213	4218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017411	TAG	2	6	4232	4237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017411	TAT	2	6	4285	4290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017411	TCT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017411	ACC	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017411	TAA	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017411	TGA	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017411	A	6	6	4644	4649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017411	A	6	6	4718	4723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017411	A	7	7	4737	4743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017411	CTC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017411	TCA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017411	A	6	6	4815	4820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017411	TAAT	2	8	4842	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017411	GAA	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017411	A	6	6	5067	5072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017411	ATG	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017411	A	6	6	5158	5163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017411	TAAGC	2	10	5176	5185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017411	CAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017411	TA	3	6	5216	5221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017411	GT	3	6	5242	5247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017411	A	6	6	5296	5301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017411	ATA	2	6	5325	5330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826845
139	NC_017411	T	8	8	5357	5364	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
140	NC_017411	GAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826845
141	NC_017411	C	6	6	5559	5564	0 %	0 %	0 %	100 %	387826845
142	NC_017411	TAAT	2	8	5573	5580	50 %	50 %	0 %	0 %	387826845
143	NC_017411	T	7	7	5608	5614	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
144	NC_017411	CTG	2	6	5615	5620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826845
145	NC_017411	T	6	6	5638	5643	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
146	NC_017411	AT	4	8	5660	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	387826845
147	NC_017411	A	9	9	5758	5766	100 %	0 %	0 %	0 %	387826845
148	NC_017411	ATT	2	6	5790	5795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826845
149	NC_017411	TTA	2	6	5800	5805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826845
150	NC_017411	AGA	2	6	5853	5858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826845
151	NC_017411	T	6	6	5926	5931	0 %	100 %	0 %	0 %	387826845
152	NC_017411	TGA	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826845
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288	NC_017411	A	7	7	10102	10108	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
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293	NC_017411	A	6	6	10199	10204	100 %	0 %	0 %	0 %	387826847
294	NC_017411	GCG	2	6	10230	10235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387826847
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